Développement de méthodes de préparation d'échantillons et d'analyse LC-MS/MS pour l'étude de protéomes de cellules uniques
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2026.
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  • Thèse avec 2 versions : seule la version intégrale est proposée ; sur authentification (communication intranet).
 
Auteur : Perdu-Alloy, Pauline
Date de soutenance : 05-12-2025

Directeur(s) de thèse : Carapito, Christine

Président : François, Yannis
Rapporteur(s) : Guerrera, Chiara - Schiltz, Odile
Membre(s) du jury : Gaudin, Raphaël

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Spectrométrie de masse, Protéomique unicellulaire, Nano LC-MS/MS, Acquisiton indépendante des données-accumulaton parallèle et fragmentaton en série (DIA-PASEF)
Mots-clés :
  • Spectrométrie de masse
  • Protéomique
  • Biologie moléculaire
Résumé : La spectrométrie de masse est une méthode de choix pour analyser le protéome, permettant d’identifier et de quantifier à haute résolution les protéines d’un mélange complexe. Les avancées récentes rendent désormais envisageable l’étude du protéome à l’échelle unicellulaire (scP), offrant une compréhension fine de l’hétérogénéité cellulaire, jusqu’alors masquée par l’approche en bulk.Toutefois, son application reste limitée en raison des défis liés aux quantités infimes de protéines disponibles par cellule unique (80-400pg). Dans ce contexte, cette thèse s’est consacrée au développement de méthodes de préparation d’échantillon et d’analyse nano LC-MS/MS dédiée à la scP. Ces optimisations ont ensuite été appliquées à des modèles biologiques, notamment dans le cadre de l’étude de l’hétérogénéité cellulaire lors d’une infection virale et le sous-typage de cellules immunitaires.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2025STRAF078
Type de ressource : Thèse