Approche systématique et intégrative pour le stockage, l'analyse et la visualisation des données d'expression génique acquises par des techniques à haut débit, dans des tissus neuronaux An integrated systematic approach for storage, analysis and visualization of gene expression data from neuronal tissues acquired through high-throughput techniques expression de gènes méta-analyse distribution de Dirichlet classification système de gestion de base de données relationnels SGBD-R rétine RETINOBASE Pas de mots clés en anglais 572.8 Bioinformatique Thèses et écrits académiques Rétine Thèses et écrits académiques Bases de données Thèses et écrits académiques Expression génique Thèses et écrits académiques Analyse des données Thèses et écrits académiques Transcription génétique Thèses et écrits académiques Le travail présenté dans ce manuscrit concerne différents aspects de l'analyse des données d'expression de gènes, qui englobe l'utilisation de méthodes statistiques et de systèmes de stockage et de visualisation, pour exploiter et extraire des informations pertinentes à partir de grands volumes de données. Durant ma thèse j'ai eu l'opportunité de travailler sur ces différents aspects, en contribuant en premier lieu aux tests de nouvelles approches de classification et de méta-analyses à travers la conception d'applications biologiques, puis dans le développement de RETINOBASE (http://alnitak.u-strasbg.fr/RetinoBase/), une base de données relationnelle qui permet le stockage et l'interrogation performante de données de transcriptomique et qui représente la partie majeure de mon travail. The work presented in this manuscript concerns different aspects of gene expression data analysis, encompassing statistical methods and storage and visualization systems used to exploit and mine pertinent information from large volumes of data. Overall, I had the opportunity during my thesis to work on these various aspects firstly, by contributing to the tests through the design of biological applications for new clustering and meta-analysis approaches developed in our laboratory and secondly, by the development of RETINOBASE (http://alnitak.u-strasbg.fr/RetinoBase/.) , a relational database for storage and efficient querying of transcriptomic data which represents my major project. Electronic Thesis or Dissertation Text en France PDF https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2008/KALATHUR_Ravi_Kiran_Reddy_2008.pdf Université de Strasbourg Strasbourg Kalathur Ravi Kiran Reddy 1979-01-01T00:00:00 FR 085107891 http://www.theses.fr/2008STR13005 2008STR13005 2008-01-15T00:00:00 Bioinformatique Université Louis Pasteur (Strasbourg) 026404540 Doctorat Docteur es non oui Poch Olivier 070441553 École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) ED414 156502844 ddc:570