Détermination de la susceptibilité génétique dans les récurrences sévères de toxoplasmose oculaire
Langue Français
Langue Français
Auteur(s) : Koch Clémence
Directeur : Sauer Arnaud
Composante : MEDECINE
Date de création : 06-10-2020
Description : Médecine. Ophtalmologie, Les récidives de toxoplasmose oculaire sont fréquentes, leur cause inconnue. L’objectif principal de cette étude est d’identifier des mutations génétiques associées à la susceptibilité aux récurrences oculaires sévères dues à Toxoplasma gondi. Une analyse comparative de l’exome a été réalisée entre 6 sujets au phénotype extrême (récurrences multiples supérieures à 5) et leurs ascendants infectés par T. gondii. Les exons des sujets présentant une sérologie toxoplasmique positive ont été séquencés et comparés entre les différentes familles. Trois variants de gènes partagés par les patients atteints à l’état homozygote et par leurs apparentés à l’état hétérozygote ont été identifiés au terme de l’analyse : C9orf50, SEC14L4 et RD3L. Notre étude a permis d’identifier trois mutations de gènes susceptibles de favoriser les récidives sévères de toxoplasmose oculaire et pourrait, ainsi, ouvrir la voie de nouvelles thérapies préventives., Recurrences of ocular toxoplasmosis (OT) may be frequent but their causes are mainly unknown. The recent development of genetic techniques allows the search for a factor of susceptibility to certain diseases. The objective of this study is to elucidate molecular risk factors for severe recurrences of OT. The present study was designed as a genetic association cohort study recruited in a single academic referral center. Exome sequencing was used to detect variants identified in patients with extreme phenotype of recurrent OT (more than 5 relapses) and compared to their ascendant or siblings also infected by T. gondii but free of any eye lesion. A phenotype-driven analysis and in silico calculations were then used to rank and predict the functional consequences of key variants. Five trios (patients and their relatives) were included. Three variants of genes shared by patients in the homozygous state and by their relatives in the heterozygous state were identified at the end of the analysis: C9orf50, SEC14L4 and RD3L. This study implicates new pathways that may be associated with recurrent OT. The pathogenicity of the mutations identified should be validated in a larger cohort and functional studies. In specific cases, whole exome sequencing could thus open the way to new preventive therapies.
Mots-clés libres : Toxoplasmose oculaire, 617.6, Prédisposition génétique à une maladie, Récidive (médecine) -- Facteurs de risque
Couverture : FR
Directeur : Sauer Arnaud
Composante : MEDECINE
Date de création : 06-10-2020
Description : Médecine. Ophtalmologie, Les récidives de toxoplasmose oculaire sont fréquentes, leur cause inconnue. L’objectif principal de cette étude est d’identifier des mutations génétiques associées à la susceptibilité aux récurrences oculaires sévères dues à Toxoplasma gondi. Une analyse comparative de l’exome a été réalisée entre 6 sujets au phénotype extrême (récurrences multiples supérieures à 5) et leurs ascendants infectés par T. gondii. Les exons des sujets présentant une sérologie toxoplasmique positive ont été séquencés et comparés entre les différentes familles. Trois variants de gènes partagés par les patients atteints à l’état homozygote et par leurs apparentés à l’état hétérozygote ont été identifiés au terme de l’analyse : C9orf50, SEC14L4 et RD3L. Notre étude a permis d’identifier trois mutations de gènes susceptibles de favoriser les récidives sévères de toxoplasmose oculaire et pourrait, ainsi, ouvrir la voie de nouvelles thérapies préventives., Recurrences of ocular toxoplasmosis (OT) may be frequent but their causes are mainly unknown. The recent development of genetic techniques allows the search for a factor of susceptibility to certain diseases. The objective of this study is to elucidate molecular risk factors for severe recurrences of OT. The present study was designed as a genetic association cohort study recruited in a single academic referral center. Exome sequencing was used to detect variants identified in patients with extreme phenotype of recurrent OT (more than 5 relapses) and compared to their ascendant or siblings also infected by T. gondii but free of any eye lesion. A phenotype-driven analysis and in silico calculations were then used to rank and predict the functional consequences of key variants. Five trios (patients and their relatives) were included. Three variants of genes shared by patients in the homozygous state and by their relatives in the heterozygous state were identified at the end of the analysis: C9orf50, SEC14L4 and RD3L. This study implicates new pathways that may be associated with recurrent OT. The pathogenicity of the mutations identified should be validated in a larger cohort and functional studies. In specific cases, whole exome sequencing could thus open the way to new preventive therapies.
Mots-clés libres : Toxoplasmose oculaire, 617.6, Prédisposition génétique à une maladie, Récidive (médecine) -- Facteurs de risque
Couverture : FR
Type : Thèse d’exercice, ressource électronique, Médecine
Source(s) :
Source(s) :
- http://www.sudoc.fr/249674645
Entrepôt d'origine :
Identifiant : ecrin-ori-103141
Type de ressource : Ressource documentaire
Identifiant : ecrin-ori-103141
Type de ressource : Ressource documentaire